Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TRIM28Q13263 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
TRIM28Q13263 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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