Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.13□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
GRIN2BQ13224 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
GRIN2BQ13224 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
GRIN2BQ13224 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
GRIN2BQ13224 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
GRIN2BQ13224 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
GRIN2BQ13224 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
GRIN2BQ13224 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
GRIN2BQ13224 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
GRIN2BQ13224 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
GRIN2BQ13224 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
GRIN2BQ13224 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
GRIN2BQ13224 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
GRIN2BQ13224 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
GRIN2BQ13224 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
GRIN2BQ13224 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
GRIN2BQ13224 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
GRIN2BQ13224 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
GRIN2BQ13224 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
GRIN2BQ13224 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
GRIN2BQ13224 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
GRIN2BQ13224 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
GRIN2BQ13224 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
GRIN2BQ13224 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
GRIN2BQ13224 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
GRIN2BQ13224 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
GRIN2BQ13224 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
GRIN2BQ13224 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
GRIN2BQ13224 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
GRIN2BQ13224 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
GRIN2BQ13224 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
GRIN2BQ13224 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
GRIN2BQ13224 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
GRIN2BQ13224 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
GRIN2BQ13224 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
GRIN2BQ13224 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
GRIN2BQ13224 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
GRIN2BQ13224 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms