Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CALCOCO2Q13137 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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