Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
IFT88Q13099 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
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