Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GPS1Q13098 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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