Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CSTF3Q12996 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CSTF3Q12996 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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