Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC-1.56□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-1.56□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC-1.56□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC-1.57□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC-1.57□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC-1.57□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.59□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.59□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
BPTFQ12830 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
BPTFQ12830 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
BPTFQ12830 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
BPTFQ12830 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
BPTFQ12830 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
BPTFQ12830 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
BPTFQ12830 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
BPTFQ12830 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
BPTFQ12830 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
BPTFQ12830 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
BPTFQ12830 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
BPTFQ12830 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
BPTFQ12830 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
BPTFQ12830 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
BPTFQ12830 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
BPTFQ12830 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
BPTFQ12830 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
BPTFQ12830 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
BPTFQ12830 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
BPTFQ12830 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
BPTFQ12830 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
BPTFQ12830 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
BPTFQ12830 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
BPTFQ12830 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
BPTFQ12830 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
BPTFQ12830 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
BPTFQ12830 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
BPTFQ12830 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
BPTFQ12830 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
BPTFQ12830 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC-1.61□□□□□ -2.67
BPTFQ12830 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
BPTFQ12830 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
BPTFQ12830 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
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