Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CHRNEQ04844 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.8 ms