Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APCP25054 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APCP25054 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APCP25054 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APCP25054 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APCP25054 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APCP25054 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APCP25054 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APCP25054 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APCP25054 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APCP25054 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APCP25054 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APCP25054 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APCP25054 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APCP25054 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APCP25054 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APCP25054 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APCP25054 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APCP25054 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APCP25054 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APCP25054 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
APCP25054 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APCP25054 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APCP25054 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APCP25054 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APCP25054 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APCP25054 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APCP25054 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APCP25054 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
APCP25054 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
APCP25054 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
APCP25054 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
APCP25054 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
APCP25054 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
APCP25054 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
APCP25054 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
APCP25054 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
APCP25054 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
APCP25054 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
APCP25054 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
APCP25054 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
APCP25054 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
APCP25054 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
APCP25054 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
APCP25054 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
APCP25054 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
APCP25054 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211.6 ms