Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SH3BP1Q9Y3L3 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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