Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
USP18Q9UMW8 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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