Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
LTBP3Q9NS15 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms