Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CIPCQ9C0C6 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CIPCQ9C0C6 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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