Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CCDC47Q96A33 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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CCDC47Q96A33 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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CCDC47Q96A33 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CCDC47Q96A33 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CCDC47Q96A33 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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