Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPN21Q16825 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPN21Q16825 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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