Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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HIF1AQ16665 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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HIF1AQ16665 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HIF1AQ16665 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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