Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.9□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKN1Q16512 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKN1Q16512 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKN1Q16512 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKN1Q16512 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKN1Q16512 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKN1Q16512 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKN1Q16512 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKN1Q16512 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKN1Q16512 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKN1Q16512 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKN1Q16512 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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