Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNGA3Q16281 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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