Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
USF2Q15853 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
USF2Q15853 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
USF2Q15853 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
USF2Q15853 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
USF2Q15853 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
USF2Q15853 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
USF2Q15853 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
USF2Q15853 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
USF2Q15853 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
USF2Q15853 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
USF2Q15853 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
USF2Q15853 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
USF2Q15853 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
USF2Q15853 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
USF2Q15853 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
USF2Q15853 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
USF2Q15853 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
USF2Q15853 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
USF2Q15853 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
USF2Q15853 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
USF2Q15853 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
USF2Q15853 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
USF2Q15853 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
USF2Q15853 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
USF2Q15853 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
USF2Q15853 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
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USF2Q15853 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
USF2Q15853 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
USF2Q15853 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
USF2Q15853 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
USF2Q15853 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
USF2Q15853 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
USF2Q15853 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
USF2Q15853 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
USF2Q15853 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
USF2Q15853 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
USF2Q15853 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
USF2Q15853 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
USF2Q15853 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
USF2Q15853 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
USF2Q15853 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
USF2Q15853 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
USF2Q15853 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
USF2Q15853 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
USF2Q15853 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
USF2Q15853 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
USF2Q15853 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
USF2Q15853 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
USF2Q15853 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
USF2Q15853 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
USF2Q15853 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
USF2Q15853 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
USF2Q15853 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
USF2Q15853 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
USF2Q15853 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
USF2Q15853 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
USF2Q15853 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
USF2Q15853 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
USF2Q15853 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
USF2Q15853 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
USF2Q15853 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
USF2Q15853 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
USF2Q15853 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
USF2Q15853 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
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USF2Q15853 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
USF2Q15853 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
USF2Q15853 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
USF2Q15853 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
USF2Q15853 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
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USF2Q15853 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
USF2Q15853 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
USF2Q15853 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
USF2Q15853 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
USF2Q15853 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
USF2Q15853 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
USF2Q15853 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
USF2Q15853 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
USF2Q15853 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
USF2Q15853 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
USF2Q15853 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
USF2Q15853 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
USF2Q15853 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
USF2Q15853 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
USF2Q15853 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
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