Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC85BQ15834 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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