Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SURF1Q15526 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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