Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
COL4A6Q14031 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms