Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF2H2Q13888 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF2H2Q13888 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF2H2Q13888 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF2H2Q13888 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF2H2Q13888 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF2H2Q13888 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF2H2Q13888 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF2H2Q13888 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF2H2Q13888 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF2H2Q13888 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF2H2Q13888 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF2H2Q13888 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF2H2Q13888 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF2H2Q13888 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF2H2Q13888 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF2H2Q13888 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF2H2Q13888 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF2H2Q13888 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF2H2Q13888 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF2H2Q13888 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
GTF2H2Q13888 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF2H2Q13888 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF2H2Q13888 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF2H2Q13888 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF2H2Q13888 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF2H2Q13888 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF2H2Q13888 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF2H2Q13888 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF2H2Q13888 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF2H2Q13888 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF2H2Q13888 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF2H2Q13888 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF2H2Q13888 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF2H2Q13888 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF2H2Q13888 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GTF2H2Q13888 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GTF2H2Q13888 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.6 ms