Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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PTCH1Q13635 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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PTCH1Q13635 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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