Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
TCOF1Q13428 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.97□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TCOF1Q13428 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TCOF1Q13428 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.9 ms