Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
ATMQ13315 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
ATMQ13315 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
ATMQ13315 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
ATMQ13315 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
ATMQ13315 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
ATMQ13315 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
ATMQ13315 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
ATMQ13315 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC-1.74□□□□□ -2.69
ATMQ13315 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
ATMQ13315 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
ATMQ13315 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
ATMQ13315 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
ATMQ13315 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
ATMQ13315 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
ATMQ13315 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
ATMQ13315 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
ATMQ13315 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
ATMQ13315 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.75□□□□□ -2.69
ATMQ13315 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
ATMQ13315 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
ATMQ13315 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
ATMQ13315 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
ATMQ13315 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
ATMQ13315 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
ATMQ13315 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
ATMQ13315 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
ATMQ13315 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
ATMQ13315 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
ATMQ13315 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
ATMQ13315 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
ATMQ13315 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
ATMQ13315 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
ATMQ13315 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
ATMQ13315 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
ATMQ13315 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
ATMQ13315 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
ATMQ13315 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
ATMQ13315 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
ATMQ13315 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
ATMQ13315 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
ATMQ13315 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
ATMQ13315 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC-1.77□□□□□ -2.69
ATMQ13315 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
ATMQ13315 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
ATMQ13315 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
ATMQ13315 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
ATMQ13315 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
ATMQ13315 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
ATMQ13315 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
ATMQ13315 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
ATMQ13315 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
ATMQ13315 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
ATMQ13315 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
ATMQ13315 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
ATMQ13315 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
ATMQ13315 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
ATMQ13315 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
ATMQ13315 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
ATMQ13315 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
ATMQ13315 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
ATMQ13315 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
ATMQ13315 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
ATMQ13315 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
ATMQ13315 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC-1.78□□□□□ -2.69
ATMQ13315 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
ATMQ13315 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
ATMQ13315 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ATMQ13315 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ATMQ13315 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ATMQ13315 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ATMQ13315 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ATMQ13315 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC-1.79□□□□□ -2.7
ATMQ13315 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ATMQ13315 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ATMQ13315 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ATMQ13315 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ATMQ13315 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ATMQ13315 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
ATMQ13315 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
ATMQ13315 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
ATMQ13315 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
ATMQ13315 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
ATMQ13315 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
ATMQ13315 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
ATMQ13315 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
ATMQ13315 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
ATMQ13315 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
ATMQ13315 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
ATMQ13315 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
ATMQ13315 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.8□□□□□ -2.7
ATMQ13315 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
ATMQ13315 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
ATMQ13315 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
ATMQ13315 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC-1.8□□□□□ -2.7
ATMQ13315 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
ATMQ13315 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
ATMQ13315 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ATMQ13315 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
ATMQ13315 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
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