Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CLN3Q13286 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.8 ms