| FLII | Q13045 | FGF14-201 | ENST00000376131 | 12882 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.37-201 | ENST00000362606 | 108 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-1290P-201 | ENST00000362957 | 109 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD23.1-201 | ENST00000408212 | 104 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | LINC01766-201 | ENST00000453968 | 362 nt | TSL 3 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | AL022345.2-201 | ENST00000606307 | 135 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | AC021506.2-201 | ENST00000612354 | 169 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | WARS-244 | ENST00000627608 | 123 nt | TSL 5 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | SENP7-201 | ENST00000314261 | 4736 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.114-201 | ENST00000363265 | 113 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | SNORA2.2-201 | ENST00000365473 | 135 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | AC015922.2-201 | ENST00000435593 | 184 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | AC074131.1-201 | ENST00000514662 | 253 nt | TSL 2 BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | RN7SKP179-201 | ENST00000516126 | 217 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | RNU7-70P-201 | ENST00000516941 | 66 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | MIR3121-201 | ENST00000579680 | 77 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | MIR5197-201 | ENST00000583721 | 112 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | APC-201 | ENST00000257430 | 10701 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | SCN1A-219 | ENST00000641575 | 12874 nt | APPRIS ALT1 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | RNU4-82P-201 | ENST00000362443 | 140 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | SNORA25.6-201 | ENST00000364121 | 118 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | SNORA67.1-201 | ENST00000364749 | 141 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
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| FLII | Q13045 | AC093850.1-201 | ENST00000454121 | 251 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
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| FLII | Q13045 | AC055731.1-201 | ENST00000474387 | 401 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | AC008892.1-201 | ENST00000511861 | 384 nt | TSL 3 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
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| FLII | Q13045 | AC079466.2-201 | ENST00000585394 | 185 nt | TSL 5 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | CLRN1-AS1.1-201 | ENST00000615643 | 79 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD3E-202 | ENST00000627253 | 216 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | AKAP9-202 | ENST00000358100 | 10309 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | MACC1-202 | ENST00000400331 | 9159 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | RNA5SP276-201 | ENST00000362580 | 94 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-508P-201 | ENST00000363231 | 103 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | RNA5SP205-201 | ENST00000364653 | 136 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | AL513328.1-201 | ENST00000446460 | 224 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | SNORA18.7-201 | ENST00000516910 | 131 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | AC133485.4-201 | ENST00000561835 | 220 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | AC138907.4-201 | ENST00000570107 | 226 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | AC004148.1-201 | ENST00000571506 | 398 nt | TSL 5 BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | U4.3-201 | ENST00000621047 | 82 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | GABRA2-209 | ENST00000510861 | 3411 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | MIR452-201 | ENST00000385020 | 85 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | RN7SKP123-201 | ENST00000410732 | 291 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | FAR2P3-204 | ENST00000434661 | 444 nt | TSL 2 BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | AL158147.1-201 | ENST00000443970 | 75 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | PGBD4P5-201 | ENST00000445958 | 426 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | AC087499.4-201 | ENST00000448505 | 178 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-1061P-201 | ENST00000516530 | 99 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD36C-201 | ENST00000516733 | 66 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | AP003484.1-201 | ENST00000530974 | 250 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | MIR4778-201 | ENST00000577635 | 80 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | AL513423.1-201 | ENST00000621695 | 132 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | COMMD6-213 | ENST00000626103 | 120 nt | TSL 5 BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-735P-201 | ENST00000410612 | 107 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-659P-201 | ENST00000516454 | 104 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | MIR4513-201 | ENST00000581077 | 86 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | MIR6733-201 | ENST00000635723 | 61 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | LINC01790-201 | ENST00000447194 | 2852 nt | TSL 2 BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | RNA5SP393-201 | ENST00000363423 | 117 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | RNA5SP456-201 | ENST00000364002 | 114 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-647P-201 | ENST00000364243 | 107 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | MIR516B2-201 | ENST00000385190 | 85 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | MIR5092-201 | ENST00000583139 | 88 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | MIR376A2-201 | ENST00000636782 | 80 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | ZNF451-208 | ENST00000491832 | 3632 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | AC007336.1-201 | ENST00000576365 | 3828 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | RGPD6-201 | ENST00000329516 | 7165 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | AP000648.3-201 | ENST00000623539 | 4507 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.9 | | |
| FLII | Q13045 | MIR660-201 | ENST00000385235 | 97 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.525-201 | ENST00000384570 | 113 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-360P-201 | ENST00000390944 | 104 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | AL359511.1-201 | ENST00000402970 | 211 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | AC099513.1-201 | ENST00000490423 | 301 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | SCARNA15-202 | ENST00000516881 | 127 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.241-201 | ENST00000364470 | 117 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | MIR136-201 | ENST00000385207 | 82 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | AL021397.1-201 | ENST00000451806 | 248 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | RNA5SP236-201 | ENST00000516169 | 116 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | WDR3-201 | ENST00000349139 | 9974 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | AC007370.2-201 | ENST00000506899 | 2694 nt | TSL 5 BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | OGN-202 | ENST00000375561 | 2743 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | RNA5SP289-201 | ENST00000362332 | 137 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | RNA5SP344-201 | ENST00000411081 | 104 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.629-201 | ENST00000411368 | 105 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | AL157709.1-201 | ENST00000412695 | 424 nt | TSL 3 BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | LINC01866-201 | ENST00000421181 | 201 nt | TSL 3 BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-772P-201 | ENST00000516042 | 105 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-830P-201 | ENST00000516353 | 107 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | AL035078.1-202 | ENST00000531627 | 413 nt | TSL 2 BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | AC099850.3-201 | ENST00000577678 | 321 nt | TSL 3 BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | MIR342-201 | ENST00000362212 | 99 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | MIR424-201 | ENST00000362227 | 98 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.351-201 | ENST00000365436 | 96 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | RNU1-138P-201 | ENST00000384093 | 164 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | TRAJ26-201 | ENST00000390511 | 60 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-938P-201 | ENST00000411285 | 103 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.651-201 | ENST00000459380 | 103 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | DLEU2_5.2-201 | ENST00000610606 | 84 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |