Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ECH1Q13011 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ECH1Q13011 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ECH1Q13011 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ECH1Q13011 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ECH1Q13011 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ECH1Q13011 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ECH1Q13011 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ECH1Q13011 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ECH1Q13011 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ECH1Q13011 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ECH1Q13011 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ECH1Q13011 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ECH1Q13011 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ECH1Q13011 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ECH1Q13011 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ECH1Q13011 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ECH1Q13011 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ECH1Q13011 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ECH1Q13011 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ECH1Q13011 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ECH1Q13011 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ECH1Q13011 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
ECH1Q13011 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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