Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHRNEQ04844 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHRNEQ04844 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHRNEQ04844 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
CHRNEQ04844 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
CHRNEQ04844 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHRNEQ04844 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHRNEQ04844 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHRNEQ04844 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHRNEQ04844 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHRNEQ04844 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHRNEQ04844 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHRNEQ04844 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHRNEQ04844 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CHRNEQ04844 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHRNEQ04844 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHRNEQ04844 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHRNEQ04844 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHRNEQ04844 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHRNEQ04844 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHRNEQ04844 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHRNEQ04844 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHRNEQ04844 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHRNEQ04844 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHRNEQ04844 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHRNEQ04844 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHRNEQ04844 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHRNEQ04844 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHRNEQ04844 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHRNEQ04844 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHRNEQ04844 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CHRNEQ04844 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHRNEQ04844 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHRNEQ04844 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHRNEQ04844 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHRNEQ04844 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHRNEQ04844 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHRNEQ04844 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHRNEQ04844 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
CHRNEQ04844 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CHRNEQ04844 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CHRNEQ04844 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CHRNEQ04844 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CHRNEQ04844 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CHRNEQ04844 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHRNEQ04844 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHRNEQ04844 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHRNEQ04844 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHRNEQ04844 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CHRNEQ04844 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHRNEQ04844 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHRNEQ04844 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CHRNEQ04844 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CHRNEQ04844 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHRNEQ04844 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CHRNEQ04844 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CHRNEQ04844 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CHRNEQ04844 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CHRNEQ04844 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CHRNEQ04844 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHRNEQ04844 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHRNEQ04844 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CHRNEQ04844 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHRNEQ04844 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHRNEQ04844 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHRNEQ04844 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNEQ04844 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms