Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
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PTPRDP23468 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
PTPRDP23468 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTPRDP23468 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
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