Protein–RNA interactions for Protein: O14717

TRDMT1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1O14717 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRDMT1O14717 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRDMT1O14717 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRDMT1O14717 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRDMT1O14717 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRDMT1O14717 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRDMT1O14717 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRDMT1O14717 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRDMT1O14717 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRDMT1O14717 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRDMT1O14717 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRDMT1O14717 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRDMT1O14717 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
TRDMT1O14717 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRDMT1O14717 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRDMT1O14717 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRDMT1O14717 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRDMT1O14717 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRDMT1O14717 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.03□□□□□ -2.4
TRDMT1O14717 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRDMT1O14717 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRDMT1O14717 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
TRDMT1O14717 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRDMT1O14717 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRDMT1O14717 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRDMT1O14717 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRDMT1O14717 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC0□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRDMT1O14717 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRDMT1O14717 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRDMT1O14717 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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