Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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SNX13Q9Y5W8 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNX13Q9Y5W8 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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SNX13Q9Y5W8 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNX13Q9Y5W8 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNX13Q9Y5W8 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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SNX13Q9Y5W8 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNX13Q9Y5W8 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNX13Q9Y5W8 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNX13Q9Y5W8 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNX13Q9Y5W8 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNX13Q9Y5W8 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SNX13Q9Y5W8 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SNX13Q9Y5W8 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SNX13Q9Y5W8 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SNX13Q9Y5W8 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SNX13Q9Y5W8 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SNX13Q9Y5W8 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SNX13Q9Y5W8 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SNX13Q9Y5W8 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SNX13Q9Y5W8 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SNX13Q9Y5W8 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SNX13Q9Y5W8 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SNX13Q9Y5W8 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SNX13Q9Y5W8 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SNX13Q9Y5W8 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SNX13Q9Y5W8 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SNX13Q9Y5W8 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SNX13Q9Y5W8 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SNX13Q9Y5W8 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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SNX13Q9Y5W8 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
SNX13Q9Y5W8 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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SNX13Q9Y5W8 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
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SNX13Q9Y5W8 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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SNX13Q9Y5W8 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SNX13Q9Y5W8 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
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SNX13Q9Y5W8 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SNX13Q9Y5W8 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SNX13Q9Y5W8 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SNX13Q9Y5W8 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SNX13Q9Y5W8 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SNX13Q9Y5W8 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SNX13Q9Y5W8 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SNX13Q9Y5W8 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
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