Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP18Q9UMW8 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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