Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
UBR3Q6ZT12 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
UBR3Q6ZT12 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
UBR3Q6ZT12 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-1.57□□□□□ -2.66
UBR3Q6ZT12 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
UBR3Q6ZT12 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
UBR3Q6ZT12 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
UBR3Q6ZT12 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
UBR3Q6ZT12 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
UBR3Q6ZT12 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
UBR3Q6ZT12 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
UBR3Q6ZT12 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
UBR3Q6ZT12 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
UBR3Q6ZT12 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
UBR3Q6ZT12 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
UBR3Q6ZT12 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
UBR3Q6ZT12 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
UBR3Q6ZT12 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
UBR3Q6ZT12 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
UBR3Q6ZT12 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
UBR3Q6ZT12 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
UBR3Q6ZT12 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
UBR3Q6ZT12 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
UBR3Q6ZT12 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
UBR3Q6ZT12 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
UBR3Q6ZT12 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
UBR3Q6ZT12 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
UBR3Q6ZT12 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
UBR3Q6ZT12 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
UBR3Q6ZT12 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC-1.59□□□□□ -2.66
UBR3Q6ZT12 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
UBR3Q6ZT12 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
UBR3Q6ZT12 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC-1.59□□□□□ -2.66
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-1.61□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.62□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC-1.62□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC-1.62□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC-1.62□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
UBR3Q6ZT12 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
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