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| FOXD4L3 | Q6VB84 | RNU6-633P-201 | ENST00000362612 | 103 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | RNU6-363P-201 | ENST00000362895 | 105 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | Y_RNA.95-201 | ENST00000363079 | 95 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
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| FOXD4L3 | Q6VB84 | RNU6-438P-201 | ENST00000365561 | 103 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
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| FOXD4L3 | Q6VB84 | Y_RNA.430-201 | ENST00000384081 | 110 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | MIR548A2-201 | ENST00000384956 | 97 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | Z92545.1-201 | ENST00000411782 | 234 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
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| FOXD4L3 | Q6VB84 | MIR3618-201 | ENST00000580330 | 88 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | MIR4305-201 | ENST00000583252 | 102 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | MIR5195-201 | ENST00000583555 | 115 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | FAS-AS1.1-201 | ENST00000615327 | 126 nt | BASIC | 3.33 | □□□□□ -1.88 | | |
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| FOXD4L3 | Q6VB84 | CCDC148-202 | ENST00000409187 | 2523 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | PRKACB-219 | ENST00000614872 | 4306 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
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| FOXD4L3 | Q6VB84 | MIR512-1-201 | ENST00000384913 | 84 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
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| FOXD4L3 | Q6VB84 | AL138962.1-201 | ENST00000417987 | 411 nt | TSL 5 BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
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| FOXD4L3 | Q6VB84 | RNU6-693P-201 | ENST00000516134 | 107 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | Y_RNA.666-201 | ENST00000516187 | 112 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | NPPA-AS1_3.1-201 | ENST00000617059 | 108 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | AC087741.2-201 | ENST00000619415 | 172 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | AC091304.10-201 | ENST00000641554 | 121 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | MINDY3-202 | ENST00000378036 | 2452 nt | TSL 2 BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | OXR1-215 | ENST00000531443 | 3599 nt | TSL 5 BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | C5orf51-201 | ENST00000381647 | 5241 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | Y_RNA.191-201 | ENST00000363972 | 113 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | RNU4ATAC16P-201 | ENST00000408512 | 126 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | AC022018.1-201 | ENST00000430685 | 241 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | SCARNA3-201 | ENST00000517097 | 143 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | LINC02386-203 | ENST00000552182 | 501 nt | TSL 3 BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | IGKV1-33-202 | ENST00000558152 | 324 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | MIR4439-201 | ENST00000583746 | 80 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | AC008507.4-201 | ENST00000585464 | 127 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | AC090115.4-201 | ENST00000609970 | 188 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | IGKV1D-33-202 | ENST00000611734 | 324 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | TSLP-202 | ENST00000379706 | 2411 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | CC2D2B-210 | ENST00000636965 | 3247 nt | TSL 5 BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | RNU4-67P-201 | ENST00000364569 | 141 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | Y_RNA.340-201 | ENST00000365330 | 92 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | SNORA2.2-201 | ENST00000365473 | 135 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | AC005703.2-201 | ENST00000453339 | 343 nt | TSL 2 BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | AC004223.1-201 | ENST00000479840 | 271 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | RNU7-70P-201 | ENST00000516941 | 66 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | RNU6-586P-201 | ENST00000517265 | 104 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | MIR203B-201 | ENST00000636080 | 86 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | FO624990.1-201 | ENST00000636373 | 85 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| FOXD4L3 | Q6VB84 | ANP32E-209 | ENST00000616917 | 2989 nt | TSL 2 BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |