Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMN1Q16637 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMN1Q16637 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.6 ms