Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
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