Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
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HERC1Q15751 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
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HERC1Q15751 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
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HERC1Q15751 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
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HERC1Q15751 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
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HERC1Q15751 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
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HERC1Q15751 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.65□□□□□ -2.51
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