Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ALX1Q15699 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ALX1Q15699 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.6 ms