Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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