Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCINQ13939 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCINQ13939 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCINQ13939 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCINQ13939 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCINQ13939 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCINQ13939 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCINQ13939 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCINQ13939 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCINQ13939 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCINQ13939 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CCINQ13939 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CCINQ13939 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCINQ13939 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCINQ13939 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CCINQ13939 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCINQ13939 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCINQ13939 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCINQ13939 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCINQ13939 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CCINQ13939 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CCINQ13939 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CCINQ13939 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCINQ13939 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCINQ13939 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCINQ13939 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCINQ13939 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCINQ13939 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCINQ13939 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCINQ13939 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCINQ13939 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CCINQ13939 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCINQ13939 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CCINQ13939 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCINQ13939 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCINQ13939 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CCINQ13939 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CCINQ13939 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CCINQ13939 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CCINQ13939 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCINQ13939 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCINQ13939 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCINQ13939 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCINQ13939 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCINQ13939 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCINQ13939 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCINQ13939 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCINQ13939 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCINQ13939 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCINQ13939 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CCINQ13939 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CCINQ13939 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CCINQ13939 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CCINQ13939 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCINQ13939 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CCINQ13939 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCINQ13939 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCINQ13939 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCINQ13939 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCINQ13939 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCINQ13939 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCINQ13939 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CCINQ13939 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CCINQ13939 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CCINQ13939 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCINQ13939 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCINQ13939 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCINQ13939 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCINQ13939 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCINQ13939 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCINQ13939 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCINQ13939 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCINQ13939 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCINQ13939 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CCINQ13939 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
CCINQ13939 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CCINQ13939 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCINQ13939 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCINQ13939 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCINQ13939 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCINQ13939 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCINQ13939 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCINQ13939 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCINQ13939 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCINQ13939 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCINQ13939 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CCINQ13939 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CCINQ13939 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CCINQ13939 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CCINQ13939 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CCINQ13939 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CCINQ13939 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CCINQ13939 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CCINQ13939 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CCINQ13939 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CCINQ13939 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CCINQ13939 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCINQ13939 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCINQ13939 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CCINQ13939 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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