Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-1.38□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC-1.38□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC-1.4□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC-1.4□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC-1.4□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-1.41□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC-1.42□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SHROOM2Q13796 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
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