Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATP1A4Q13733 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATP1A4Q13733 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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