Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTCH1Q13635 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
PTCH1Q13635 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
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