Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL3Q13618 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL3Q13618 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
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