Protein–RNA interactions for Protein: Q13454

TUSC3, Tumor suppressor candidate 3, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUSC3Q13454 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TUSC3Q13454 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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