Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
SF3B2Q13435 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SF3B2Q13435 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
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