Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.69
MKRN4PQ13434 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
MKRN4PQ13434 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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