Protein–RNA interactions for Protein: Q13330

MTA1, Metastasis-associated protein MTA1, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1Q13330 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
MTA1Q13330 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MTA1Q13330 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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